Bộ phim là phần tiếp theo của phim Star Trek. Trong phần này, sau khi được gọi về trái đất, những phi hành gia phát hiện ra tổ chức của mình đã bị phá hoại bởi một thế lực không đơn giản nào đó. Và người cựu thuyền trưởng của con tàu vũ trụ Enterprise bị sát hại bởi một kẻ lạ mặt. Đau đớn trước cái chết của ông, Kirk cùng con tàu vũ trụ Enterprise và các phi hành đoàn lại bắt đầu một cuộc hành trình mới, truy tìm kẻ đã giết vị cựu thuyền trưởng vĩ đại của họ. Nhưng lúc này họ lại khám phá ra một bí mật khủng khiếp và họ nhận ra những gì họ nhìn thấy chưa phải là sự thật họ từng biêt. Bí mật khủng khiếp đó là gì? Liệu họ có sống sót trở về?